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我國科研團隊構(gòu)建全球首個牧草圖形泛基因組

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日期:2023-03-14 21:23:58    來源:科技日報    


(資料圖片)

陳科

3月14日筆者從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,該校黃琳凱教授團隊構(gòu)建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組,并揭示了狼尾草耐熱的分子機制,相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上。

美洲狼尾草,又名珍珠粟,全球種植面積約3100萬公頃。在我國,它是一種重要飼草。在研究過程中,黃琳凱團隊聯(lián)合國內(nèi)外多家單位,從全球8個地區(qū)收集的394份美洲狼尾草核心種質(zhì)中選取了10份代表性材料,將基因組從頭組裝,獲得了高質(zhì)量的基因組組裝序列,并結(jié)合已報道的基因組構(gòu)建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組,共發(fā)掘424085個結(jié)構(gòu)變異。

同時,基于對泛基因組圖譜進行全基因組關(guān)聯(lián)分析,團隊還發(fā)現(xiàn)了143個重要農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的變異位點,并挖掘到與產(chǎn)量性狀相關(guān)的候選基因446個。黃琳凱表示,與參考基因組相比,圖形泛基因組包含的遺傳信息更全面,通過發(fā)掘其中的結(jié)構(gòu)變異,能夠更好地解析植物表型和農(nóng)藝性狀的不同,為下一步育種奠定重要的研究基礎(chǔ)。“該項研究可加速攻關(guān)牧草業(yè)各環(huán)節(jié)‘卡脖子’技術(shù),培育突破性牧草優(yōu)良品種,助力提升優(yōu)質(zhì)安全食物的供給保障能力,為國家糧食安全貢獻草業(yè)科研的力量。”她說。

美洲狼尾草高質(zhì)量基因組組裝和泛基因組分析。受訪者供圖

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